離子交換樹脂結構主要由高分子骨架和活性基團兩部分組成。
（1）高分子骨架  也稱母體結構，它具有網狀結構，是不溶于酸或堿的高分子物質。高分子骨架按其聚合單體可以分為苯乙烯系、酚醛系及丙烯酸系等。
（2）活性基團  它牢固地結合在高分子骨架上，由不能自由移動的官能團離子和可以自由移動的可交換離子兩部分組成。其中：①官能團離子決定離子交換樹脂的“酸”、“堿”性和交換能力的強弱。官能團離子是強酸的（-SO3-），就叫強酸性離子交換樹脂；是強堿的（≡N+），就叫強堿性離子交換樹脂。同樣，按官能團離子的性質，還可以有弱酸（-COO-），弱堿（-NH2+）和其他類型的離子交換樹脂。②可交換離子。現代交換理論把離子交換樹脂看做是一種膠體型物質：高分子骨架是“膠核”，活性基團作為高分子骨架表面的“雙電層”，官能團和部分可交換離子組成吸附層，另一部分可交換離子組成擴散層。由于可交換離子組成吸附層，另一部分可交換離子組成擴散層。由于可交換離子是可以自由移動的，因而可以與水中同符號的離子發生交換反應。
    如果離子交換樹脂上的可交換離子為陽離子，例如H+，就叫H型陽離子交換樹脂；如果可交換離子為陰離子，例如OH-，就叫OH型陰離子交換樹脂。其余可依次類推。